首波異動 林鎮夷接任參謀總長

霍守業轉戰略顧問
總統府人士透露，馬英九原本不願意在全民拼經濟之際，進行軍方高階將領的異動，但國防部卻希望調動霍守業，以舒緩陸、海軍擁擠的人事壓力，因此，陳肇敏即在農曆年前向馬上「大簽」，建議將霍轉戰略顧問、林鎮夷接總長、趙世璋接副部長、楊天嘯接陸軍司令；另外還建議陸軍副司令李清國中將接任總政戰局長，並晉升上將，但未獲馬同意。
由於國防部並未將其他建議名單一併呈上，讓府方感覺國防部並不尊重馬英九的「三軍統帥權」，也因此馬並未在過年前批定大簽，而在幾經討論後才決定上將的異動。
民進黨立委蔡同榮質疑：「軍方這次作法等於架空馬總統的三軍統帥人事權！」如果以前有上將人事由總統圈選的慣例，為何不依照以前的慣例，讓總統有選擇的空間？綠委薛凌也質疑，從這次人事全由陳肇敏主導可以看出，「陳肇敏儼然是馬英九的影子統帥。」

總政戰局長仍懸缺
國民黨立委則力挺國防部，立委林郁方認為，這次人事主導應該是在陳肇敏，因為馬英九的個性是各有所司、分層負責、用人不疑；而軍系立委帥化民認為，總統本來就有權可以做調整。
對綠營批國防部上大簽恐有侵犯統帥權之虞，總統府發言人王郁琦說，內部公文作業不方便評論；軍事發言人池玉蘭也否認此事，強調國防部均依《任職任官條例》規定辦理。
總統府人士指出，根據國防部所公布的高階將領異動，「顯見馬英九並沒有完全同意國防部的建議。」也因此，國防部所公布的總政戰局長一職，仍是懸缺未定。此外，空軍也傳出將於三月異動，由陳肇敏推薦的愛將、空軍副司令雷玉其中將接任空軍司令，並晉升二級上將；扁的愛將、空軍司令彭勝竹上將退伍。

國軍將官人事異動
資料來源：《蘋果》資料室