最高檢察署特別偵查組「第一班」，即將在四月間謝幕，朱朝亮、吳文忠及沈明倫三名資深檢察官確定離開，換上台灣高檢署檢察官鄭富銘、莊正、姜貴昌等「特偵二班」，接手偵辦扁家弊案。

中信金控大少辜仲諒前後共給扁珍三億元，會是下一波檢察官起訴扁珍的重點。

斷層多 偵查瓶頸
首先落在特偵二班的弊案，可能就是機密外交案，最近特偵組也快馬加鞭加強機密外交的蒐證，指揮台北市調查處，在三月二十三日到土城台北看守所，約談前總統陳水扁，但特偵組偵辦機密外交案與二次金改案同樣也遇到瓶頸。
消息人士透露，二次金改的難度在於確立對價關係，而機密外交則是太機密，就像前第一夫人吳淑珍三月十七日受審時說：「機密外交案只有阿扁才清楚，連邱義仁、馬永成也只是知道一部分而已。」而這也正是特偵組的痛苦，邱、馬二人如果願意吐實，也只是部分，無法讓特偵組全盤掌握，而且如果涉及外國人士，要將外國人約談到案的機會則更小。
知情人士指出，特偵組最近調查五百萬美元的「醫和專案」，發現極力要促成我國加入世界衛生組織（WHO）的韓國醫療界重要人物Park Tung San，及其在中間來台負責聯絡政府高層的一位韓裔李姓女子，二人都已被美國下令限制出境，讓特偵組調查備加困難。
特偵組調查，二○○四年阿扁連任後，積極推動台灣加入WHO，透過管道輾轉連絡到韓籍的Park Tung San幫忙，他還安排李姓女助理從美國來台接洽，由邱義仁等人接待，因此編列了五百萬美元的機密外交預算。但因為效果不彰，五百萬美元分成三筆：一百五十萬、一百五十萬及二百萬美元的預算，結果只執行了一期就結束。

林全當財政部長時，不僅被要求安插陳敏薰人事，還要處理金控合併。

拚外交 金流成謎
消息人士透露，韓籍的Park推動的外交案不只「醫和專案」一件，他還與中南美洲多起外交案件有關，算是台灣外交工作的重要推手，而他也因遊說法的相關問題被美國下令限制出境，由美國司法相關單位調查中。特偵組發現，台灣的外交工作可能過於仰賴他，也讓他有機可趁。
特偵組查出，Park有次主動表示台灣的中美洲邦交國即將要與我國斷交，他可以從中斡旋進而維持邦誼，不過索費上千萬美元。本來總統府要照單全收，負責外交事務的黃志芳透過其管道協調，查明事情並非如Park所說那麼嚴重，台灣差點被他牽著鼻子走，變成了冤大頭。
也因為如此，特偵組調查發現「醫和專案」第一期一百五十萬美元的執行過程，是使用不連號的舊美鈔，更讓全案疑點重重，除了要求陳水扁前總統說明外，還準備透過台美司法互助協定的平台，希望美方就此部分能協助台灣調查。